Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 FAM13C-215ENST00000614220 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 XPO1-203ENST00000406957 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ANKRD20A19P-203ENST00000602724 295 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
HOXD11P31277 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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