Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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USP18Q9UMW8 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
USP18Q9UMW8 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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