Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FOXQ1Q9C009 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms