Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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