Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USF2Q15853 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USF2Q15853 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
USF2Q15853 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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