Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RABGEF1Q9UJ41 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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