Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC092111.1-201ENST00000618256 3358 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
FOXD1Q16676 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms