Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms