Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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