Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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