Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010478.1-201ENST00000601500 6762 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD54L2-201ENST00000409535 9776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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