Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TAF1CQ15572 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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