Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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COL9A2Q14055 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A2Q14055 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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