Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PTPRSQ13332 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRSQ13332 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms