Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK4Q16099 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms