Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CACNA1SQ13698 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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