Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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TRIM35Q9UPQ4 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TRIM35Q9UPQ4 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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TRIM35Q9UPQ4 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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