Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOS2-202ENST00000621962 3345 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR1D2-202ENST00000641064 4882 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CALN1-202ENST00000395275 9459 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RALGDS-204ENST00000393157 3689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUDCD2-201ENST00000302764 8005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNIH4-205ENST00000465271 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNNT3-202ENST00000344578 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CST9LP1-201ENST00000376987 444 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNNT3-205ENST00000381563 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNNT3-209ENST00000397304 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNNT3-210ENST00000446240 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS12P20-201ENST00000464109 380 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKAG2-AS1-201ENST00000464464 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL653P-201ENST00000494134 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV1-27-201ENST00000498435 382 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E159P-201ENST00000553761 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4EBP1P1-201ENST00000557776 341 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093249.3-201ENST00000562444 424 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4518-201ENST00000580665 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 snoZ6.4-201ENST00000581669 55 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL804P-201ENST00000582466 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC215522.1-201ENST00000615488 446 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK2AP2P1-201ENST00000617479 328 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355987.5-201ENST00000621585 411 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADD3-AS1-203ENST00000625954 472 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC6A2-202ENST00000379906 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP1G1-202ENST00000393512 3593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC113-201ENST00000219299 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GULP1-201ENST00000359135 3347 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLCXD2-205ENST00000636933 7710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNT2-201ENST00000294725 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAXO2-201ENST00000339465 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM111A-211ENST00000533703 4202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRE-202ENST00000306042 4957 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NNT-208ENST00000512996 4288 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TYRP1-203ENST00000388918 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCR9-203ENST00000395963 2512 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNE1-201ENST00000337385 3347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL592158.1-201ENST00000632210 4477 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMPRSS4-AS1-204ENST00000636151 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMER1-201ENST00000330258 8443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms