Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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DDB1Q16531 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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