Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
TUBB3Q13509 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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TUBB3Q13509 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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TUBB3Q13509 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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TUBB3Q13509 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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