Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PDE3BQ13370 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms