Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM3-201ENST00000314425 5536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TRANK1-201ENST00000429976 10481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STX17-201ENST00000259400 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD6-201ENST00000379485 5178 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMCH1-219ENST00000514096 3543 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR711-201ENST00000390201 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FCAR-206ENST00000391724 762 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR941-2-201ENST00000401322 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR941-4-201ENST00000401376 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MT1P3-201ENST00000421424 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018738.1-201ENST00000441378 210 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107983.1-201ENST00000442562 210 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf98P1-201ENST00000446114 318 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 COX7CP1-201ENST00000446556 192 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KCTD21-AS1-202ENST00000523626 555 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004801.5-201ENST00000552958 550 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AP007216.1-201ENST00000563932 385 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PPCDC-210ENST00000568649 926 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFB10P2-201ENST00000568872 478 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4253-201ENST00000581187 68 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC096708.1-201ENST00000584419 658 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006504.5-211ENST00000588636 576 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020913.1-202ENST00000599360 467 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6848-201ENST00000611213 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8078-201ENST00000619811 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC000041.2-201ENST00000619824 151 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR941-5-201ENST00000621667 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR941-3-201ENST00000637366 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF1-201ENST00000335891 4114 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PRAMENP-202ENST00000419303 1869 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF24-201ENST00000379174 5729 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ITIH1-211ENST00000537050 2493 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GBP6-201ENST00000370456 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX19P2-201ENST00000452841 2971 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMO2-204ENST00000396391 3574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPO-201ENST00000260662 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 NCAM1-229ENST00000621518 4922 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 COL25A1-209ENST00000622134 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SMYD1-201ENST00000419482 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPR1-219ENST00000544951 4131 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS9-204ENST00000396127 3914 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093390.1-201ENST00000426976 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00661-204ENST00000549354 3340 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
KRTAP4-12Q9BQ66 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms