Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC4A4Q9Y6R1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC4A4Q9Y6R1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms