Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX8Q9Y5X2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX8Q9Y5X2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms