Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP16Q9Y5T5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms