Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDP1Q9Y5B0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms