Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
DCAF1Q9Y4B6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms