Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y261

FOXA2, Hepatocyte nuclear factor 3-beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA2Q9Y261 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXA2Q9Y261 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms