Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNH4Q9UQ05 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH4Q9UQ05 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms