Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms