Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM35Q9UPQ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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