Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB23Q9ULC3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms