Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGA11Q9UKX5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms