Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CROTQ9UKG9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms