Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO3Q9UK99 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO3Q9UK99 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms