Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHF11Q9UIL8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms