Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP2BPQ9P2M1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP2BPQ9P2M1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms