Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USP36Q9P275 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms