Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHRF1Q9P1Y6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms