Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNRD1Q9P1U0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms