Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20BQ9P0W2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms