Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4Q9P0V3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4Q9P0V3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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