Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMOD3Q9NYL9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMOD3Q9NYL9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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