Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CWC25Q9NXE8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms