Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DCAF13Q9NV06 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms