Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC39A9Q9NUM3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC39A9Q9NUM3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms