Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TOPORSQ9NS56 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms