Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTPS2Q9NRF8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms