Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CHST12Q9NRB3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHST12Q9NRB3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms