Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FZD3Q9NPG1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms